تأسست كلية الطب البشري الزنتان في العام الجامعي 2015-2016 م ويعتبر قسم الاطفال أحد اهم الاقسام في المرحلة السريرية مع قسمي الباطنة والجراحة وبدأت العملية التعليمية في القسم في العام الجامعي 2020-2021م . وتدرس مادة طب الاطفال في المرحلة الثالثة السريرية في السنة الخامسة ويليها مرحلة التدريب التكميلي (الامتياز) منها شهران لطب الاطفال في أحد المستشفيات التعليمية. ويضم حاليا قسم الاطفال 3 اعضاء هيئة تدريس قارين و5 اعضاء متعاونين. طرق التدريس بالقسم تشمل دروس نظرية وحلقات نقاش وكذلك الجزء السريري (العملي) وتعقد الامتحانات في مادة طب الاطفال بشقيها النظري والعملي بدور اول وثاني.